Придя в сознание, старшеклассник Асагая Шин стал ИИ для космического линкора. Корабль оказывается в окружении с повреждённым двигателем, что ставит его в чрезвычайно трудное положение.
Следующие действия происходят спустя 10 000 лет: мальчик превращается в невероятно мощного ИИ и возглавляет небольшой флот.